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Introduction à l'analyse de données métatranscriptomiques avec Galaxy

Publié le 8 février 2024 Mis à jour le 13 février 2024
Date(s)

le 9 octobre 2024

La formation à l’utilisation de la plateforme de bio-analyse Galaxy aura lieu le mercredi 09 octobre de 9h-12h.
Lieu(x)
Batiment Turing, 7 avenue Blaise Pascal, Campus des Céseaux, 63170, Aubière.

L’objectif de cette formation est de se familiariser avec les étapes et les outils d’analyse de données métatranscriptomiques dans le but de comprendre les fonctions d’une communauté microbienne. Nous proposons au personnel non-bioinformaticien de les accompagner dans la prise en main de ces étapes en utilisant la plateforme de bio-analyse Galaxy.

Après une introduction à la métagénomique, une session pratique sur la plateforme Galaxy couvrira comment :

  • assigner des taxons à des données de métatranscriptomiques,
  • extraire des informations fonctionnelles au sein de données de métatranscriptomiques,
  • combiner informations taxonomiques et fonctionnelles pour faciliter la compréhension des fonctions d’une communauté microbienne


Cette formation se base sur le contenu du Galaxy Training Network (GTN) où plus de 300 tutoriels sont mis à disposition sur le web (https://training.galaxyproject.org/)

La formation ouverte au personnel de l’UCA & Associés, ayant des jeux de données à analyser dans les domaines de la bio-analyse et/ou des bio-statistiques

Pour suivre la formation, il est nécessaire de :

  • Avoir un ordinateur portable et un accès wifi eduroam
  • Avoir un compte sur la plateforme Galaxy (Faire une demande le cas échéant sur hub.mesocentre.uca.fr)
  • Être familier avec Galaxy

Inscription via le formulaire suivant avant le 28 Février 2024 : https://framaforms.org/cycle-de-formations-mensuelles-a-lanalyse-de-donnees-sur-galaxy-1707229580