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Formation 2022 : Pratiques FAIR en bioinformatique

Publié le 1 décembre 2022 – Mis à jour le 1 décembre 2022
Date(s)

du 28 novembre 2022 au 2 décembre 2022

Lieu(x)
Batiment Turing, 7 avenue Blaise Pascal, Campus des Céseaux, 63170, Aubière.

Session d'introduction aux principes FAIR en bioinformatique. Les principes FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, réutilisable) sont abordés et pratiqués à travers la présentation et la pratique de Git, Conda, Docker, Singularity, Snakemake, Rmarkdown et jupyterLab.

Les objectifs de cette formation de 20h est l'introduction aux bonnes pratiques en bioinformatique afin de pérenniser le travail de recherche. Les notions abordées sont la reproductibilité et la répétabilité du code ainsi que les bonnes pratiques de partage et gestion des versions des outils utilisés dans un contexte FAIR.

Cette formation permet de découvrir les bonnes pratiques dans le cadre d’un travail nécessitant des approches programmatiques (statistiques, programmation d’outils, analyses de données biologiques).

Elle s’inscrit aussi dans l’aspect science-ouverte afin de rendre plus facilement disponible le travail bioinformatique.


Nombre de places : 10