Publié le 4 mai 2026 – Mis à jour le 4 mai 2026
Complément date
de 9h à 17h30
Lieu(x)
Batiment Turing, 7 avenue Blaise Pascal, Campus des Céseaux, 63170, Aubière.

Session de formation à la Science Reproductible : git et Quarto, du code à la présentation des résultats.

L’objectif de cette formation est d’aller un peu plus loin que la formation d’initiation proposée dans le cadre FAIR-Bioinfo? Il est question de se familiariser aux bonnes pratiques en bio-informatique afin de pérenniser et rendre reproductible son travail de recherche. À la fin de la formation, les apprenants seront capables de :
  • Maîtriser le cycle de vie complet d’un dépôt Git (versionnage, branches, historique) ;
  • Appliquer des (meilleures) pratiques de collaboration à distance (gestion des conflits et workflows) ;
  • Produire une documentation intégrée au code via la programmation littérale pour rendre l’analyse reproductible par autrui ou par son "moi du futur" ;
  • Générer dynamiquement des supports visuels mis-à-jour en temps réel dans le cadre de présentations ou de rapports d’analyses.

La formation est organisée par la plateforme AuBi et le Mésocentre Clermont-Auvergne, en collaboration avec le service de formation continue de l'Université Clermont Auvergne.
Cette formation est créée pour et par des Biologistes Bio-analystes et/ou bioinformaticien.ne.s.
Les formateur.ice.s sont : Pierre Marin (GDEC, INRAE), Jonathan Kitt (GDEC, INRAE), Yoan Renaud (iGReD, CNRS) et Nadia Goué (Mésocentre Clermont-Auvergne, UCA)

Nombre de places est limité : 12 personnes

Date limite pour les inscriptions : le 18 juin 2026

Contact pour les renseignements : aubi_at_uca.fr

Fiche descriptive de la formation ici