Publié le 2 octobre 2024 – Mis à jour le 15 janvier 2025
Journée Annuelle de la plateforme AuBi co-organisée avec le Master 1 Bioinformatique
Journée Annuelle de la plateforme AuBi co-organisée avec le Master 1 Bioinformatique
Complément date



 

Lieu(x)
Amphi 9109, Pôle Physique, Campus des Cézeaux, UCA, Aubière

La plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi) et les étudiants du Master 1 Bioinformatique vous propose une journée d'animation le mercredi 04 décembre 2024 intitulée :

Journée annuelle d'animation de la plateforme AuBi
L'évènement est sponsorisé par la Société Française de Bioinformatique (sfbi.fr)
 

La Journée annuelle Biologie et Informatique est gratuite et ouverte à toutes et tous. Bien que les inscriptions au buffet (Pause déjeuner) soient maintenant closes, vous êtes toujours les bienvenu.e.s pour assister aux présentations.

8:30-9:00 Accueil des participant.e.s

9:00-9:10 Ouverture et Introduction par Pierre Peyret (Resp. Scientifique AuBi et MEDIS) et Nadia Goué (Resp. Opérationnel et co-Resp. Technique AuBi, Mésocentre Clermont-Auvergne)


9:10-9:30 Christophe Tatout (iGRED) - Exploration de la dynamique nucléaire et chromatinienne chez la plante modèle Arabidopsis thaliana: Applications et développements en bioanalyse et bio-imagerie
    Mots clés : Bioanalyse, Bioimagerie, Snakemake, Alphafold, Deep-learning
9:30-9:50 Panos Sapountzis (MEDIS ) - From Farm to Genome: Tracking spatiotemporal changes in E. coli from cattle
    Mots clés : E.coli, genomics, evolution, spatiotemporal, cattle farms
9:50-10:10 Didier Debroas (LMGE) - Global Analysis of the Metaplasmidome: Ecological Drivers and Spread of Antibiotic Resistance Genes Across Ecosystems
    Mots clés : Resistome, metaplasmidome, One Health

10:10-10:40  Pause café
 

10:40-11:00 Faustine Souc et Nils Pauhle (UNH) - Évolution des technologies pour construire des outils de bioinformatique: cas pratique en metabolomique
    Mots clés : Metabolomics, Microservices, Cloud, Webcomponents, FAIR

11:00-11:20 Francis Ogereau (Mésocentre) - Atelier de la donnée GO.TO.DO.UCA (Gérer, Ouvrir, Trouver, Obtenir les DOnnées à L'Université Clermont Auvergne)
    Mots clés : Données / Métadonneés, PGD, Entrepôt, Formation, FAIR
11:20-12:00 Jeremy Mezhoud et Lucie Guérin (Mésocentre) - Le CEBA : un data lake pour stocker et partager ses données de recherche
    Mots clés : Données, Environnement, Stockage, FAIR, IoT

12:00-14:00  Pause déjeuner
 
14:00-14:50 Guy Perrière (IFB) - Activités de services de l’IFB pour la communauté des biologistes et des bioinformaticiens
    Mots-clés : infrastructures nationales, cluster, cloud, formation, Europe

14:50-15:10 Clea Siguret (AuBi / IFB) - ABRomics : une plateforme basée sur Galaxy pour la recherche sur la résistance aux antibiotiques et la santé publique
    Mots clés : Galaxy, Antibio-résistance, One Health, FAIR, Surveillance
15:10-15:30 Aurélien Birer (CNR) - BaSaV : Histoire d’un projet bio-informatique évolutif du CNR « Résistance aux antibiotiques » au Mésocentre
    Mots clés : Antibio-résistance, Gestion de projet, Plateforme Web, CNR
15:30-15:50 Bérénice Batut (AuBi / IFB) - Demystifying ELIXIR: Unlocking Opportunities for Your Work
    Mots clés : Bioinformatics, Infrastructure, Resources, Collaborations, Europe
 

15:50-16:00 Conclusions et clôture de la journée


18:00 JEBIF PUB - La Bamboche (5 Rue Saint-Dominique, 63000 Clermont-Ferrand), inscription toujours possible en suivant ce lien.

JEBIFpub
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