Journée AuBi Bioinfo-NGS 2022

• 08:30 – Accueil des participants
• 08:45 – Pierre Peyret (MEDIS) : Présentation de la plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi)
• 08:50 - Christophe Tatout (iGReD) : Présentation du Master Bioinformatique de l'UCA
• 09:00 - Hélène Rimbert, Pauline Lasserre-Zuber : (GDEC, équipe Bioinfo) : présentations courtes d'anciennes étudiantes de Master Bioinformatique
• 09:20 - Cécile Lepère (LMGE) : Approches omiques pour déchiffrer la diversité et le rôle fonctionnel des micro-organismes dans les écosystèmes aquatiques
• 09:40 - Philippe Label (PIAF) : Mesure des pores d'aquaporines avec un workflow de dynamique moléculaire sur la plateforme Galaxy de AuBi

10:00 - Pause Café
 

• 10:30 - Joris Mordier (iGReD) : Étude de la fonction du variant d'histone H2A.B au cours de la spermatogenèse par Single-Cell RNA-seq
• 10:50 - Oshma Chakoory (MEDIS) : RIBOTAXA: les nouveautés révélées par des approches combinées de métagénomique pour la résolution taxonomique jusqu'au niveau de l'espèce
• 11:10 - Nils Stein (IPK) : One genome, many genomes – the pangenome of barley

Après-midi

• 14:00 - Christophe Blanchet (IFB) : IFB Cloud et services numériques pour les sciences de la vie
• 15:00 - David Grimbichler, Nadia Goué (Mésocentre, AuBi) : Infrastructure du Mésocentre et panorama des ressources et des activités de la plateforme AuBI

• 15:50 - Lorène Belval (ANSES) : Développement de la détection des parasites de plantes par séquençage à haut-débit pour la station de quarantaine post-entrée française
• 16:10 - Frédéric Choulet (GDEC) : Aperçu des projets développés au GDEC sur la génomique et la bioinformatique du blé
• 16:30 - Pierre Marin (IFB, AuBi) : ABRomics, une plateforme numérique sur la résistance antimicrobienne pour stocker, intégrer, analyser et partager des données multi-omiques
• 16:50 - Conclusions