Nouvel article AuBi dans Microbiome : "Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes"

Intitulé "Metatranscriptomes-based sequence similarity networks uncover genetic signatures within parasitic freshwater microbial eukaryotes", cette étude se distingue par son utilisation de réseaux de similarité de séquences pour analyser les métabolismes spécifiques des micro-organismes eucaryotes dans le lac Pavin, en France. Contrairement aux recherches précédentes, cette méthode a permis d'inclure un grand nombre de séquences sans références dans les bases de données publiques, augmentant ainsi la quantité de données analysables.

Les chercheurs ont réussi à identifier plus de 2 millions de protéines, révélant des signatures génétiques spécifiques aux parasites obligatoires. Cette découverte ouvre de nouvelles perspectives pour comprendre les interactions hôte-parasite et pourrait conduire à des avancées significatives dans le développement de traitements antiparasitaires.

Les auteurs tiennent à remercier le Mésocentre et la plateforme AuBi pour leur soutien crucial en termes de ressources de calcul et de stockage, indispensables à la réalisation de cette recherche.

Pour en savoir plus sur cette étude fascinante, vous pouvez consulter l'article complet sur le site de Microbiome: https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-02027-0