Recherche
Service Cloud Biosphère
Publié le 9 juin 2026 – Mis à jour le 10 juin 2026
Actualité : Un nouvel environnement de travail pour l’analyse comportementale par IA sur le Cloud Biosphère
La plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi) et le Mésocentre Clermont-Auvergne, en collaboration avec l’Institut Français de Bioinformatique (IFB), propose le service Cloud Biosphère, une infrastructure dédiée à la bio-analyse pour la recherche et la formation.
Grâce à Biosphère, les scientifiques paramètrent, depuis une interface web ergonomique, des machines virtuelles en spécifiant des ressources (CPU, mémoire et stockage) et activent des environnements spécialisés, que l’on appelle « appliance » contenant les outils nécessaires aux bio-analyses telles que les analyses omiques, imagerie, etc... Plus d'une cinquantaine d'environnement sont disponibles et maintenus par la communauté bioinformatique française.
Une avancée majeure : l’appliance « Images Behaviors » Dans le cadre de son stage de Master 2 Informatique sur la plateforme AuBi, Fabien Leloup, Ingénieur au laboratoire Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC) a développé une nouvelle appliance pour le catalogue Biosphère : « Images Behaviors ».
Cette appliance permet d’analyser des comportements biologiques à partir d’images ou de vidéos, en utilisant des outils d’intelligence artificielle (IA).
Les outils intégrés :
Un déploiement optimisé : Pour gagner du temps, ces outils sont paramétrables dès le lancement de la machine virtuelle, sans configuration manuelle complexe.
Comment en bénéficier ?
L’appliance est disponible dans le catalogue Biosphère : Accéder à l’appliance « Images Behaviors »
Besoin d’aide ?
Contactez l’équipe du Mésocentre de l’UCA ou la plateforme AuBi pour toute question : mesocentre@uca.fr, aubi@uca.fr
Grâce à Biosphère, les scientifiques paramètrent, depuis une interface web ergonomique, des machines virtuelles en spécifiant des ressources (CPU, mémoire et stockage) et activent des environnements spécialisés, que l’on appelle « appliance » contenant les outils nécessaires aux bio-analyses telles que les analyses omiques, imagerie, etc... Plus d'une cinquantaine d'environnement sont disponibles et maintenus par la communauté bioinformatique française.
Une avancée majeure : l’appliance « Images Behaviors » Dans le cadre de son stage de Master 2 Informatique sur la plateforme AuBi, Fabien Leloup, Ingénieur au laboratoire Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC) a développé une nouvelle appliance pour le catalogue Biosphère : « Images Behaviors ».
Cette appliance permet d’analyser des comportements biologiques à partir d’images ou de vidéos, en utilisant des outils d’intelligence artificielle (IA).
Les outils intégrés :
- DeepLabCut : Détection précise de positions d’objets ou de cellules
- LabGym : Analyse de mouvements et apprentissage par renforcement
- A-Soid / B-Soid : Segmentation et quantification de comportements
- DeepEthoGram : Classification automatique de séquences comportementales
- QuPath : Analyse d’images biomédicales (histologie, cytologie)
Un déploiement optimisé : Pour gagner du temps, ces outils sont paramétrables dès le lancement de la machine virtuelle, sans configuration manuelle complexe.
Comment en bénéficier ?
L’appliance est disponible dans le catalogue Biosphère : Accéder à l’appliance « Images Behaviors »
Besoin d’aide ?
Contactez l’équipe du Mésocentre de l’UCA ou la plateforme AuBi pour toute question : mesocentre@uca.fr, aubi@uca.fr