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Introduction à l'analyse de données de séquençage avec contrôle qualité et alignement sur un génome de référence avec Galaxy

Publié le 8 février 2024 – Mis à jour le 13 février 2024
Date(s)

le 10 avril 2024

La formation à l’utilisation de la plateforme de bio-analyse Galaxy aura lieu le mercredi 10 avril de 9h-12h.
Lieu(x)
Batiment Turing, 7 avenue Blaise Pascal, Campus des Céseaux, 63170, Aubière.

L’objectif est de se familiariser avec les premières étapes communes à toutes les analyses de données de séquençage : le contrôle qualité des données et l’alignement sur un génome de référence. Nous proposons au personnel non-bioinformaticien de les accompagner dans la prise en main des ces étapes d’analyses en utilisant la plateforme de bio-analyse Galaxy.

Après une introduction aux données de séquençage, une session pratique sur la plateforme Galaxy couvrira comment :

  • évaluer la qualité de données de séquençage,
  • améliorer la qualité de données de séquençage
  • aligner des données sur un génome de référence


Cette formation se base sur le contenu du Galaxy Training Network (GTN) où plus de 300 tutoriels sont mis à disposition sur le web (https://training.galaxyproject.org/)

La formation ouverte au personnel de l’UCA & Associés, ayant des jeux de données à analyser dans les domaines de la bio-analyse et/ou des bio-statistiques

Pour suivre la formation, il est nécessaire de :

  • Avoir un ordinateur portable et un accès wifi eduroam
  • Avoir un compte sur la plateforme Galaxy (Faire une demande le cas échéant sur hub.mesocentre.uca.fr)
  • Être familier avec Galaxy

Inscription via le formulaire suivant avant le 28 Février 2024 : https://framaforms.org/cycle-de-formations-mensuelles-a-lanalyse-de-donnees-sur-galaxy-1707229580