Introduction à l'analyse de données de séquençage avec contrôle qualité et alignement sur un génome de référence avec Galaxy
L’objectif est de se familiariser avec les premières étapes communes à toutes les analyses de données de séquençage : le contrôle qualité des données et l’alignement sur un génome de référence. Nous proposons au personnel non-bioinformaticien de les accompagner dans la prise en main des ces étapes d’analyses en utilisant la plateforme de bio-analyse Galaxy.
Après une introduction aux données de séquençage, une session pratique sur la plateforme Galaxy couvrira comment :
- évaluer la qualité de données de séquençage,
- améliorer la qualité de données de séquençage
- aligner des données sur un génome de référence
Cette formation se base sur le contenu du Galaxy Training Network (GTN) où plus de 300 tutoriels sont mis à disposition sur le web (https://training.galaxyproject.org/)
La formation ouverte au personnel de l’UCA & Associés, ayant des jeux de données à analyser dans les domaines de la bio-analyse et/ou des bio-statistiques
Pour suivre la formation, il est nécessaire de :
- Avoir un ordinateur portable et un accès wifi eduroam
- Avoir un compte sur la plateforme Galaxy (Faire une demande le cas échéant sur hub.mesocentre.uca.fr)
- Être familier avec Galaxy
Inscription via le formulaire suivant avant le 28 Février 2024 : https://framaforms.org/cycle-de-formations-mensuelles-a-lanalyse-de-donnees-sur-galaxy-1707229580