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Introduction à l'annotation de génomes bactériens avec Galaxy

Publié le 8 février 2024 – Mis à jour le 13 février 2024
Date(s)

le 15 mai 2024

La formation à l’utilisation de la plateforme de bio-analyse Galaxy aura lieu le mercredi 15 mai de 9h-12h.
Lieu(x)
Batiment Turing, 7 avenue Blaise Pascal, Campus des Céseaux, 63170, Aubière.

L’objectif est cette formation de se familiariser avec les étapes et les outils pour annoter des génomes bactériens. Nous proposons au personnel non-bioinformaticien de les accompagner dans la prise en main de l’annotation de génomes bactériens en utilisant la plateforme de bio-analyse Galaxy.

Après une introduction à l’annotation de génomes bactériens, une session pratique sur la plateforme Galaxy couvrira comment :

  • faire tourner une série d’outils pour annoter un génome bactérien avec différents éléments génomiques,
  • évaluer l’annotation
  • visualiser un génome bactérien et ses annotations


Cette formation se base sur le contenu du Galaxy Training Network (GTN) où plus de 300 tutoriels sont mis à disposition sur le web (https://training.galaxyproject.org/)

La formation ouverte au personnel de l’UCA & Associés, ayant des jeux de données à analyser dans les domaines de la bio-analyse et/ou des bio-statistiques

Pour suivre la formation, il est nécessaire de :

  • Avoir un ordinateur portable et un accès wifi eduroam
  • Avoir un compte sur la plateforme Galaxy (Faire une demande le cas échéant sur hub.mesocentre.uca.fr)
  • Être familier avec Galaxy

Inscription via le formulaire suivant avant le 28 Février 2024 : https://framaforms.org/cycle-de-formations-mensuelles-a-lanalyse-de-donnees-sur-galaxy-1707229580